Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
URB1O60287 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
URB1O60287 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
URB1O60287 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
URB1O60287 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
URB1O60287 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
URB1O60287 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
URB1O60287 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
URB1O60287 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
URB1O60287 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
URB1O60287 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
URB1O60287 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
URB1O60287 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
URB1O60287 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
URB1O60287 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
URB1O60287 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
URB1O60287 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
URB1O60287 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
URB1O60287 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
URB1O60287 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
URB1O60287 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
URB1O60287 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
URB1O60287 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
URB1O60287 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
URB1O60287 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
URB1O60287 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
URB1O60287 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
URB1O60287 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
URB1O60287 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
URB1O60287 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
URB1O60287 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
URB1O60287 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
URB1O60287 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
URB1O60287 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
URB1O60287 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
URB1O60287 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
URB1O60287 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
URB1O60287 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
URB1O60287 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
URB1O60287 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
URB1O60287 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
URB1O60287 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
URB1O60287 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
URB1O60287 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
URB1O60287 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
URB1O60287 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
URB1O60287 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
URB1O60287 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
URB1O60287 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
URB1O60287 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
URB1O60287 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
URB1O60287 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
URB1O60287 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
URB1O60287 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
URB1O60287 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
URB1O60287 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
URB1O60287 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
URB1O60287 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
URB1O60287 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
URB1O60287 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
URB1O60287 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
URB1O60287 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
URB1O60287 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
URB1O60287 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
URB1O60287 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
URB1O60287 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
URB1O60287 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
URB1O60287 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
URB1O60287 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
URB1O60287 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
URB1O60287 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
URB1O60287 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
URB1O60287 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
URB1O60287 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
URB1O60287 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
URB1O60287 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
URB1O60287 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
URB1O60287 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms