Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFSF12O43508 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFSF12O43508 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF12O43508 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF12O43508 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF12O43508 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF12O43508 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF12O43508 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF12O43508 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF12O43508 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF12O43508 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms