Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COCHO43405 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COCHO43405 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COCHO43405 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COCHO43405 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COCHO43405 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COCHO43405 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COCHO43405 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COCHO43405 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COCHO43405 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COCHO43405 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COCHO43405 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COCHO43405 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COCHO43405 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COCHO43405 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COCHO43405 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COCHO43405 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COCHO43405 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COCHO43405 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COCHO43405 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COCHO43405 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COCHO43405 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COCHO43405 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COCHO43405 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COCHO43405 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COCHO43405 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COCHO43405 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COCHO43405 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COCHO43405 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COCHO43405 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COCHO43405 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COCHO43405 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COCHO43405 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COCHO43405 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COCHO43405 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COCHO43405 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COCHO43405 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COCHO43405 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COCHO43405 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COCHO43405 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COCHO43405 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COCHO43405 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COCHO43405 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COCHO43405 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COCHO43405 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COCHO43405 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COCHO43405 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COCHO43405 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COCHO43405 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COCHO43405 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COCHO43405 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COCHO43405 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COCHO43405 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COCHO43405 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COCHO43405 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COCHO43405 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COCHO43405 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COCHO43405 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COCHO43405 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COCHO43405 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COCHO43405 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COCHO43405 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COCHO43405 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COCHO43405 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COCHO43405 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COCHO43405 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COCHO43405 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COCHO43405 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COCHO43405 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COCHO43405 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COCHO43405 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COCHO43405 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COCHO43405 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COCHO43405 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COCHO43405 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COCHO43405 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COCHO43405 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COCHO43405 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COCHO43405 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COCHO43405 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COCHO43405 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COCHO43405 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COCHO43405 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COCHO43405 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COCHO43405 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COCHO43405 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COCHO43405 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COCHO43405 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COCHO43405 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COCHO43405 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COCHO43405 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms