Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTIFO43310 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTIFO43310 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTIFO43310 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTIFO43310 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTIFO43310 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTIFO43310 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTIFO43310 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTIFO43310 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTIFO43310 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTIFO43310 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTIFO43310 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTIFO43310 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTIFO43310 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTIFO43310 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTIFO43310 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTIFO43310 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTIFO43310 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTIFO43310 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTIFO43310 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTIFO43310 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTIFO43310 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTIFO43310 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTIFO43310 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTIFO43310 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTIFO43310 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTIFO43310 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTIFO43310 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTIFO43310 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTIFO43310 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTIFO43310 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTIFO43310 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTIFO43310 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTIFO43310 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTIFO43310 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTIFO43310 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTIFO43310 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTIFO43310 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTIFO43310 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTIFO43310 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTIFO43310 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTIFO43310 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTIFO43310 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTIFO43310 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTIFO43310 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTIFO43310 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTIFO43310 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTIFO43310 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTIFO43310 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTIFO43310 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTIFO43310 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTIFO43310 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTIFO43310 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTIFO43310 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTIFO43310 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTIFO43310 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTIFO43310 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTIFO43310 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTIFO43310 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTIFO43310 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTIFO43310 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTIFO43310 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTIFO43310 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTIFO43310 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTIFO43310 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTIFO43310 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTIFO43310 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTIFO43310 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTIFO43310 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTIFO43310 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTIFO43310 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTIFO43310 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTIFO43310 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTIFO43310 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTIFO43310 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTIFO43310 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTIFO43310 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTIFO43310 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTIFO43310 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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