Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPAA1O43292 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAA1O43292 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPAA1O43292 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPAA1O43292 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPAA1O43292 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms