Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEFVO15553 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEFVO15553 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEFVO15553 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEFVO15553 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEFVO15553 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEFVO15553 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEFVO15553 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEFVO15553 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEFVO15553 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEFVO15553 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEFVO15553 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEFVO15553 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEFVO15553 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEFVO15553 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEFVO15553 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEFVO15553 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEFVO15553 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEFVO15553 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEFVO15553 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEFVO15553 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEFVO15553 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEFVO15553 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEFVO15553 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEFVO15553 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEFVO15553 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEFVO15553 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEFVO15553 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEFVO15553 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEFVO15553 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEFVO15553 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEFVO15553 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MEFVO15553 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEFVO15553 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEFVO15553 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEFVO15553 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEFVO15553 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MEFVO15553 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEFVO15553 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEFVO15553 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEFVO15553 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEFVO15553 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEFVO15553 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEFVO15553 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEFVO15553 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEFVO15553 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEFVO15553 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEFVO15553 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEFVO15553 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEFVO15553 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEFVO15553 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MEFVO15553 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEFVO15553 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEFVO15553 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MEFVO15553 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEFVO15553 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEFVO15553 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MEFVO15553 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MEFVO15553 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEFVO15553 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEFVO15553 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEFVO15553 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEFVO15553 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEFVO15553 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MEFVO15553 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEFVO15553 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEFVO15553 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEFVO15553 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEFVO15553 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEFVO15553 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEFVO15553 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEFVO15553 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEFVO15553 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEFVO15553 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEFVO15553 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEFVO15553 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEFVO15553 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms