Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FANCAO15360 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FANCAO15360 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FANCAO15360 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FANCAO15360 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FANCAO15360 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FANCAO15360 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FANCAO15360 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FANCAO15360 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FANCAO15360 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FANCAO15360 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FANCAO15360 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FANCAO15360 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FANCAO15360 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FANCAO15360 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FANCAO15360 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FANCAO15360 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FANCAO15360 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FANCAO15360 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FANCAO15360 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FANCAO15360 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FANCAO15360 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
FANCAO15360 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
FANCAO15360 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FANCAO15360 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FANCAO15360 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCAO15360 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCAO15360 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCAO15360 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCAO15360 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCAO15360 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCAO15360 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCAO15360 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCAO15360 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCAO15360 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCAO15360 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCAO15360 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCAO15360 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCAO15360 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCAO15360 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCAO15360 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCAO15360 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCAO15360 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCAO15360 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCAO15360 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCAO15360 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCAO15360 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCAO15360 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCAO15360 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCAO15360 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCAO15360 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCAO15360 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCAO15360 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCAO15360 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCAO15360 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCAO15360 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCAO15360 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCAO15360 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCAO15360 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCAO15360 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCAO15360 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCAO15360 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCAO15360 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCAO15360 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCAO15360 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCAO15360 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCAO15360 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCAO15360 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCAO15360 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCAO15360 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCAO15360 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCAO15360 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCAO15360 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCAO15360 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCAO15360 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCAO15360 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCAO15360 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCAO15360 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCAO15360 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCAO15360 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FANCAO15360 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FANCAO15360 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FANCAO15360 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCAO15360 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCAO15360 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCAO15360 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCAO15360 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
FANCAO15360 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCAO15360 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCAO15360 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCAO15360 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCAO15360 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCAO15360 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCAO15360 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCAO15360 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCAO15360 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCAO15360 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCAO15360 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCAO15360 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCAO15360 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms