Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM6BO15054 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM6BO15054 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM6BO15054 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM6BO15054 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM6BO15054 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM6BO15054 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM6BO15054 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM6BO15054 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
KDM6BO15054 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
KDM6BO15054 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM6BO15054 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM6BO15054 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM6BO15054 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms