Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFRD1O00458 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFRD1O00458 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms