Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAP23O00161 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAP23O00161 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAP23O00161 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms