Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms