Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP17L21D6R901 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP17L21D6R901 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L21D6R901 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms