Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ERVV-1B6SEH8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVV-1B6SEH8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms