Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DEV8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DEV8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DEV8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DEV8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DEV8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DEV8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DEV8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DEV8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DEV8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DEV8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DEV8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DEV8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DEV8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DEV8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DEV8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DEV8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DEV8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DEV8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DEV8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DEV8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DEV8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DEV8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
B4DEV8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DEV8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DEV8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DEV8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DEV8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DEV8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DEV8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DEV8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DEV8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4DEV8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B4DEV8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DEV8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DEV8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DEV8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DEV8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DEV8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DEV8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DEV8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DEV8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4DEV8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
B4DEV8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4DEV8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4DEV8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4DEV8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms