Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLCA2A8K830 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms