Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB15A6NHN6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB15A6NHN6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms