Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA6L3A6NEY3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L3A6NEY3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms