Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

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Length 84 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WXM4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WXM4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WXM4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A087WXM4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A087WXM4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WXM4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WXM4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WXM4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WXM4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WXM4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WXM4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WXM4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WXM4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WXM4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WXM4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WXM4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WXM4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WXM4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WXM4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WXM4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WXM4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WXM4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WXM4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WXM4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WXM4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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