Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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