Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms