Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms