Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms