Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms