Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms