Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms