Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOMER3Q9NSC5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms