Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms