Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms