Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms