Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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