Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NYXQ9GZU5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms