Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
BPESC1Q9GZL8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms