Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms