Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF7Q9BWX1 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms