Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CINPQ9BW66 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms