Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms