Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms