Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms