Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms