Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECSITQ9BQ95 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms