Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GFI1Q99684 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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GFI1Q99684 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GFI1Q99684 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GFI1Q99684 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GFI1Q99684 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GFI1Q99684 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFI1Q99684 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GFI1Q99684 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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GFI1Q99684 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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GFI1Q99684 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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GFI1Q99684 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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GFI1Q99684 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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GFI1Q99684 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFI1Q99684 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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GFI1Q99684 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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