Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAM1Q96QH2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAM1Q96QH2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAM1Q96QH2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms