Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM47Q96LD4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms