Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS6Q96GS4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms