Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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