Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms