Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms