Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms