Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYRIPQ8NFW9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms