Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms