Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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